Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VdrP48281 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VdrP48281 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VdrP48281 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VdrP48281 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VdrP48281 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VdrP48281 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VdrP48281 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VdrP48281 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VdrP48281 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms