Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13P47963 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms