Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syt1P46096 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syt1P46096 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms