Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms