Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms