Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tac1P41539 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms