Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VhlP40338 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VhlP40338 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VhlP40338 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VhlP40338 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VhlP40338 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms