Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms