Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PpardP35396 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PpardP35396 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PpardP35396 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpardP35396 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpardP35396 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpardP35396 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpardP35396 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpardP35396 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpardP35396 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpardP35396 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpardP35396 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpardP35396 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpardP35396 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpardP35396 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpardP35396 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpardP35396 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms