Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab20P35295 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms