Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms