Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms