Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms