Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms