Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms