Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms