Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms