Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms