Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2afxP27661 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms