Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
U2af2P26369 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
U2af2P26369 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms