Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CftrP26361 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CftrP26361 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CftrP26361 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CftrP26361 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CftrP26361 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CftrP26361 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CftrP26361 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CftrP26361 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CftrP26361 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CftrP26361 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CftrP26361 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CftrP26361 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CftrP26361 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CftrP26361 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CftrP26361 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CftrP26361 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CftrP26361 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CftrP26361 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CftrP26361 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CftrP26361 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CftrP26361 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CftrP26361 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CftrP26361 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CftrP26361 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CftrP26361 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CftrP26361 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CftrP26361 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CftrP26361 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CftrP26361 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CftrP26361 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CftrP26361 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CftrP26361 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CftrP26361 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CftrP26361 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CftrP26361 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CftrP26361 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CftrP26361 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CftrP26361 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CftrP26361 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CftrP26361 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CftrP26361 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CftrP26361 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CftrP26361 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CftrP26361 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CftrP26361 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CftrP26361 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CftrP26361 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CftrP26361 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CftrP26361 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CftrP26361 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms