Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms