Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms