Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BdnfP21237 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BdnfP21237 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BdnfP21237 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BdnfP21237 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BdnfP21237 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BdnfP21237 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BdnfP21237 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BdnfP21237 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BdnfP21237 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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