Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms