Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NefhP19246 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NefhP19246 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NefhP19246 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NefhP19246 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NefhP19246 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NefhP19246 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NefhP19246 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NefhP19246 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NefhP19246 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms