Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifrd1P19182 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms