Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18526 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18526 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms