Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsdP18242 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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