Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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PcnaP17918 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PcnaP17918 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnaP17918 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms