Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms