Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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