Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PrphP15331 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PrphP15331 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrphP15331 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrphP15331 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrphP15331 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrphP15331 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrphP15331 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrphP15331 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrphP15331 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrphP15331 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrphP15331 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms