Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnmt1P13864 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms