Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vpreb1P13372 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms