Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx1P13297 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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