Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms