Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctla2bP12400 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctla2bP12400 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctla2bP12400 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2bP12400 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctla2bP12400 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms