Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd1d1P11609 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms