Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prf1P10820 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms