Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Schip1P0DPB4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms