Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms