Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms