Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms