Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrygdP04342 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygdP04342 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CrygdP04342 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms