Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04213 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04213 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04213 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P04213 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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