Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01653 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01653 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms