Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01648 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01648 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01648 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01648 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
P01648 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01648 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01648 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01648 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01648 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01648 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01648 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01648 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01648 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01648 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01648 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01648 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01648 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01648 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01648 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms