Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01641 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01641 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01641 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01641 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01641 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01641 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01641 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01641 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01641 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01641 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01641 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01641 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01641 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01641 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01641 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01641 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01641 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01641 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01641 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01641 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01641 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01641 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01641 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.3 ms