Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms